De innovatiebox is per 1 januari 2017 beperkt tot octrooien, patentachtige rechten (zoals kwekersrechten) en software die beschermd is met auteursrechten/copyrights. Dit vloeit voort uit het BEPS-rapport van de OESO; een actieplan tegen belastingontduiking. Innovatieve ondernemers in het MKB (de genoemde ‘kleine belastingplichtigen’) kunnen de innovatiebox ook gebruiken voor een immaterieel activum dat voortvloeit uit speur- en ontwikkelingswerk waarvoor een S&O-verklaring is afgegeven. Zonder de goedkeuring zouden immateriële activa die na 30 juni 2016 worden voortgebracht vanaf 1 januari 2017 aan de nieuwe regels voor toepassing van de innovatiebox moeten voldoen. De goedkeuring in het besluit voorkomt dit. Hierdoor behoudt de VSO ook na 1 januari 2017 zijn geldigheid voor deze immateriële activa.
